Nesta obra fundamental, Giorgio Agamben destrincha os procedimentos formais e as escolhas metodológicas que fundamentam seu percurso filosófico ao abordar três figuras conceituais: o paradigma, a assinatura e a arqueologia. Dialógico desde o Título, que faz referência ao nono tratado de Paracelso (De signatura rerum naturalium), este livro sobre o método se constrói pelo entrelaçamento do discurso de Agamben com os de Foucault, Benjamin, Paracelso, Warburg, Overbeck e Melandri.
Signatura rerum organiza-se em três ensaios. O primeiro, "O que é um paradigma?", reconstrói a teoria do exemplo e da analogia, verdadeira lacuna na história da lógica ocidental. O segundo ensaio, "Teoria das assinaturas", faz uma genealogia sobre o papel do pesquisador e sua habilidade de rastrear e usar assinaturas. O terceiro e último ensaio, "Arqueologia filosófica", segue a tradição foucaultiana de análise das relações entre história e arqueologia, que remonta a um conceito de origem que não permanece isolado no passado, continua agindo no presente. O entrelace dessas três figuras define o espaço de um breve tratado sobre o método.